Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- s -

• S() : VoxelPoolsBase
• s2m_ : CubeMesh
• s_ : Test
• S_ : VoxelPoolsBase
• samples_ : Stats
• saturation_ : DiffAmp , PIDController
• save() : SimpleLogger
• savedVm_ : IzhikevichNrn
• SCALE : ReadCspace
• scale_ : Adaptor , Nernst
• scaleBufAndRates() : Neuron
• scaleBufsAndRates() : Stoich
• scaleHeadDiffusion() : Neuron
• scaleShaftDiffusion() : Neuron
• scaleVolsBufsRates() : VoxelPoolsBase
• sdev_ : Stats
• second : VoxelJunction
• SecondOrder() : SecondOrder
• secondPulse_ : PulseGen
• secondVol : VoxelJunction
• seed_ : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler , HSolve , moose::RNG< T > , SparseMsg
• segId_ : Neuron
• segIndex_ : Neuron
• segs_ : Neuron , ReadSwc , SwcBranch
• selectGridSize() : CylBase
• selectGridVolume() : CylMesh
• selectPower() : ChannelStruct , HHChannel2D , HHChannelBase
• send() : SpikeGenStruct , SrcFinfo0 , SrcFinfo1< T > , SrcFinfo2< T1, T2 > , SrcFinfo3< T1, T2, T3 > , SrcFinfo4< T1, T2, T3, T4 > , SrcFinfo5< T1, T2, T3, T4, T5 > , SrcFinfo6< T1, T2, T3, T4, T5, T6 >
• sendBuf_ : PostMaster
• sendBuffer() : SrcFinfo0 , SrcFinfo1< T > , SrcFinfo2< T1, T2 > , SrcFinfo3< T1, T2, T3 > , SrcFinfo4< T1, T2, T3, T4 > , SrcFinfo5< T1, T2, T3, T4, T5 > , SrcFinfo6< T1, T2, T3, T4, T5, T6 > , SrcFinfo
• sendProcessMsgs() : ChanCommon
• sendReinitMsgs() : ChanCommon
• sendSize_ : PostMaster
• sendSpikes() : HSolveActive
• sendTo() : SrcFinfo1< T > , SrcFinfo2< T1, T2 >
• sendValues() : HSolveActive
• sendVec() : SrcFinfo1< T >
• sensed_ : PIDController
• separateSpines_ : NeuroMesh
• separateVols() : ReadKkit
• seqActivation_ : SeqSynHandler
• seqDt_ : SeqSynHandler
• SeqSynHandler() : SeqSynHandler
• sequencePower_ : SeqSynHandler
• sequenceScale_ : SeqSynHandler
• set() : Field< A > , FuncOrder , LookupField< L, A > , SetGet0 , SetGet1< A > , SetGet2< A1, A2 > , SetGet3< A1, A2, A3 > , SetGet4< A1, A2, A3, A4 > , SetGet5< A1, A2, A3, A4, A5 > , SetGet6< A1, A2, A3, A4, A5, A6 > , SparseMatrix< T > , TgtInfo
• set_ : LookupElementValueFinfo< T, L, F > , LookupValueFinfo< T, L, F > , ValueFinfoBase
• setA() : IzhikevichNrn , moose::IzhIF
• setA0() : moose::AdExIF , moose::AdThreshIF , moose::IzhIF , moose::QIF
• setAbsoluteAccuracy() : MarkovGslSolver
• setAccommodating() : IzhikevichNrn
• setActivation() : DifBufferBase
• setAllowNegative() : Stoich
• setAlpha() : HHGate , IzhikevichNrn
• setAlwaysDiffuse() : CubeMesh
• setAMinus() : STDPSynHandler
• setAMinus0() : STDPSynHandler
• setAngle() : Spine
• setAPlus() : STDPSynapse
• setAPlus0() : STDPSynHandler
• setApower() : EndoMesh
• setAscale() : EndoMesh
• setB() : CaConcBase , IzhikevichNrn , moose::IzhIF
• setB0() : moose::AdExIF , moose::IzhIF
• setBad() : SwcSegment
• setBaseLevel() : PulseGen
• setBaseScale() : SeqSynHandler
• setBBound() : DifBufferBase
• setBeta() : HHGate , IzhikevichNrn
• setBFree() : DifBufferBase
• setBindIndex() : SrcFinfo
• setBistable() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setBlock() : Dsolve , Gsolve , Ksolve , ZombiePoolInterface
• setBTot() : DifBufferBase
• setBufferSize() : PostMaster
• setC() : DifShellBase , IzhikevichNrn
• setC0() : moose::IzhIF
• setCa() : CaConcBase , CaConcStruct , GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler , HSolve
• setCaAdvance() : HSolve
• setCaBasal() : CaConcBase , CaConcStruct , HSolve
• setCaCeiling() : HSolve
• setCaDiv() : HSolve
• setCaFloor() : HSolve
• setCaInit() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setCaMax() : HSolve
• setCaMin() : HSolve
• setCapacitance() : RC
• setCaPost() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setCaPre() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setCeiling() : CaConcBase
• setCeq() : DifShellBase
• setChannelDistribution() : Neuron
• setChildConcs() : ChemCompt
• setCin() : Nernst
• setClockedUpdate() : Gsolve
• setCm() : HSolve , moose::CompartmentBase
• setCM() : Neuron
• setCMg() : MgBlock , NMDAChan
• setColor() : Annotator
• setColumnName() : Table
• setCommand() : moose::VClamp , PIDController
• setCompartment() : Dsolve , Gsolve , Stoich , ZombiePoolInterface
• setCompartmentLengthInLambdas() : Neuron
• setConc() : PoolBase
• setConcInit() : PoolBase
• setConcK1() : CplxEnzBase
• setConcKb() : ReacBase
• setConcKf() : ReacBase
• setCondFraction() : NMDAChan
• setConst() : Function
• setConstantRate() : MarkovRateTable
• setConvergenceCriterion() : SteadyState
• setCoords() : CubeMesh , CylMesh
• setCount() : PulseGen
• setCout() : Nernst
• setCumulativeDistance() : SwcSegment
• setCwe() : Shell
• setD() : DifBufferBase , DifShellBase , IzhikevichNrn , moose::IzhIF
• setDataSize() : LocalDataElement
• setDelay() : PulseGen , Synapse
• setDelayD() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setDeltaThresh() : moose::ExIF
• setDia() : CylBase
• setDiameter() : CaConcBase , DifBufferBase , DifShellBase , moose::CompartmentBase
• setDiffConst() : DiffPoolVec , Dsolve , Gsolve , Ksolve , PoolBase , VoxelPoolsBase , ZombiePoolInterface
• setDiffLength() : CylMesh , NeuroMesh
• setDiffScale() : CubeMesh , Dsolve
• setDiffusionAndTransport() : FastMatrixElim
• setDiffVol1() : Dsolve
• setDiffVol2() : Dsolve
• setdirpath() : Annotator
• setDiv() : VectorTable
• setDivs() : HHGate
• setDoAxialDiffusion() : EndoMesh
• setDoEvalAtReinit() : Function
• setDoLoop() : StimulusTable
• setDoPeriodic() : RandSpike
• setDsolve() : Dsolve , Gsolve , Ksolve , Stoich , ZombiePoolInterface
• setDt() : Clock , HSolve
• setDx() : CubeMesh , Interpol2D
• setDy() : CubeMesh , Interpol2D
• setDz() : CubeMesh
• setEdgeTriggered() : SpikeGen
• setEigenvalue() : SteadyState
• setEk() : ChanBase , HSolve
• setElist() : Stoich
• setEm() : HSolve , moose::CompartmentBase , Neuron
• setEntireVolume() : ChemCompt
• setEntry() : SparseMsg
• setEntryPairs() : SparseMsg
• setEnzK1() : Stoich
• setEnzK2() : Stoich
• setEnzK3() : Stoich
• setEpsAbs() : Ksolve
• setEpsRel() : Ksolve
• setExpr() : Func , FuncRate , FuncTerm , Function
• setExtCa() : NMDAChan
• setFilename() : TimeTable
• setFirstDelay() : PulseGen
• setFirstLevel() : PulseGen
• setFirstWidth() : PulseGen
• setFloor() : CaConcBase
• setFormat() : Streamer , Table
• setFuncArgIndex() : FuncRate
• setFunction() : Arith
• setFunctionExpr() : Stoich
• setGain() : DiffAmp , moose::VClamp , PIDController
• setGamma() : IzhikevichNrn
• setGammaD() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setGammaP() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setGatePower() : HHChannel2D , HHChannel
• setGbar() : ChanBase
• setGbars() : MarkovChannel
• setGeomAndElec() : moose::CompartmentBase
• setGeometricalDistanceFromSoma() : SwcSegment
• setGeometryPolicy() : NeuroMesh
• SetGet() : SetGet
• SetGet0() : SetGet0
• SetGet1() : SetGet1< A >
• SetGet2() : SetGet2< A1, A2 >
• SetGet3() : SetGet3< A1, A2, A3 >
• SetGet4() : SetGet4< A1, A2, A3, A4 >
• SetGet5() : SetGet5< A1, A2, A3, A4, A5 >
• SetGet6() : SetGet6< A1, A2, A3, A4, A5, A6 >
• setGk() : ChanBase , GapJunction , HSolve
• setGlobals() : PyRun
• setHandler() : STDPSynapse , Synapse
• setHardware() : Shell
• setHeadDiameter() : Spine
• setHeadLength() : Spine
• setHeadVolume() : Spine
• setHHChannelGbar() : HSolve
• setHHmodulation() : HSolve
• setHistoryTime() : SeqSynHandler
• setI1() : OneToAllMsg , SingleMsg
• setI2() : SingleMsg
• setIcon() : Annotator
• setId() : DiffPoolVec , TestId
• setIdentifiedArg() : Arith
• setIk() : ChanBase
• setInclination() : Spine
• setIndependent() : Function
• setIndex() : OpFunc
• setInitDt() : VoxelPools
• setInitialState() : MarkovChannel , MarkovSolverBase
• setInitString() : PyRun
• setInitU() : IzhikevichNrn
• setInitVm() : HSolve , IzhikevichNrn , moose::CompartmentBase
• setInject() : HSolve , IzhikevichNrn , moose::CompartmentBase , RC
• setInjectMsg() : RC
• setInnerArea() : DifBufferBase , DifShellBase
• setInputOffset() : Adaptor
• setInputVar() : PyRun
• setInstant() : HHChannel2D , HHChannelBase , HSolve
• setInt2dChildTable() : MarkovRateTable
• setIntCa() : NMDAChan
• setIntCaOffset() : NMDAChan
• setIntCaScale() : NMDAChan
• setInternalDt() : MarkovGslSolver
• setIsBuffered() : PoolBase
• setIsCylinder() : CylBase
• setIsMembraneBound() : ChemCompt
• setIsToroid() : CubeMesh
• setJunctionVol() : CubeMesh
• setK() : ZeroOrder
• setK1() : CplxEnzBase
• setK2() : CplxEnzBase
• setKb() : DifBufferBase
• setKcat() : EnzBase , MMEnzymeBase
• setKd() : MMPump
• setKernelEquation() : SeqSynHandler
• setKernelWidth() : SeqSynHandler
• setKf() : DifBufferBase
• setKm() : EnzBase , MMEnzymeBase
• setKMg_A() : MgBlock , NMDAChan
• setKMg_B() : MgBlock , NMDAChan
• setKmK1() : Enz
• setKsolve() : Stoich
• setLeak() : DifShellBase
• setLength() : CaConcBase , CylBase , DifBufferBase , DifShellBase , moose::CompartmentBase
• setLevel() : PulseGen
• setLigandConc() : MarkovChannel , MarkovRateTable
• setLigandGated() : MarkovChannel
• setLocals() : PyRun
• setLookupParams() : MarkovSolverBase
• setLoopTime() : StimulusTable
• setMatrix() : SparseMsg
• setMax() : HHGate , VectorTable
• setMaximumSize() : Spine
• setMaxIter() : SteadyState
• setMeshEntryVolume() : ChemCompt , PsdMesh , SpineMesh
• setMeshToSpace() : CubeMesh
• setMethod() : Cell , ChemCompt , Ksolve , MarkovGslSolver , TimeTable
• setMin() : HHGate , VectorTable
• setMinfinity() : HHGate
• setMinimumSize() : Spine
• setMMenzKcat() : Stoich
• setMMenzKm() : Stoich
• setMode() : Func , Function , moose::VClamp , PyRun
• setmodeltype() : Annotator
• setModulation() : ChanBase
• setMolN() : SteadyState
• setMolWt() : Species
• setMotorConst() : DiffPoolVec , Dsolve , PoolBase , ZombiePoolInterface
• setMoveOntoCompartment() : ReadKkit
• setN() : DiffPoolVec , Dsolve , Gsolve , Ksolve , PoolBase , VoxelPoolsBase , ZombiePoolInterface
• setName() : Element , Neutral
• setNinit() : DiffPoolVec , Dsolve , Gsolve , Ksolve , PoolBase , VoxelPoolsBase , ZombiePoolInterface
• setNoiseSD() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setNoisy() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setNormalizeWeights() : SynChan
• setNotes() : Annotator
• setNum_ : FieldElementFinfoBase
• setNumAllVoxels() : Dsolve , Gsolve , Ksolve , ZombiePoolInterface
• setNumChan() : ConcChan
• setNumData() : Neutral
• setNumDivs() : CylBase
• setNumEntries() : ChemCompt
• setNumField() : FieldElementFinfo< T, F > , FieldElementFinfoBase , Neutral
• setNumField_ : FieldElementFinfo< T, F >
• setNumFinfo() : Cinfo
• setNumGates() : HHChannel2D , HHChannelBase
• setNumKb() : ReacBase
• setNumKf() : ReacBase
• setNumKm() : EnzBase
• setNumOpenStates() : MarkovChannel
• setNumPools() : Dsolve , Gsolve , Ksolve , ZombiePoolInterface
• setNumReac() : GssaVoxelPools
• setNumSpines() : Neuron
• setNumStates() : MarkovChannel
• setNumSynapses() : SynHandlerBase
• setNumVar() : Function
• setNumVoxels() : DiffPoolVec
• setNvec() : DiffPoolVec , Dsolve , Gsolve , Ksolve
• setNx() : CubeMesh
• setNy() : CubeMesh
• setNz() : CubeMesh
• setOneVoxelVolume() : ChemCompt
• setOneWay() : Stoich
• setOps() : DiffPoolVec
• setOuterArea() : DifBufferBase , DifShellBase
• setOutfile() : Table
• setOutFilepath() : Streamer , StreamerBase
• setOutput() : Arith
• setOutputOffset() : Adaptor
• setOutputValue() : TableBase
• setOutputVar() : PyRun
• setParent() : NeuroNode , SpineEntry , SwcSegment
• setParentAndChildren() : NeuroNode
• setPassiveDistribution() : Neuron
• setPath() : Dsolve , HSolve , Stoich
• setPermeability() : ConcChan , NMDAChan
• setPhi() : Neuron
• setPlasticityScale() : SeqSynHandler
• setPlotDump() : TableBase
• setPowers() : ChannelStruct , HSolve
• setPreserveNumEntries() : CubeMesh
• setPrev() : Dsolve , ZombiePoolInterface
• setPrevVec() : DiffPoolVec
• setProbability() : SparseMsg
• setPsdArea() : Spine
• setR0() : CylMesh
• setR1() : BidirectionalReaction , CylMesh , ExternReac , MMEnzymeBase , RateTerm , ZeroOrder
• setR2() : BidirectionalReaction , ExternReac , MMEnzymeBase , RateTerm , ZeroOrder
• setRa() : HSolve , moose::CompartmentBase
• setRA() : Neuron
• setRandInit() : Gsolve
• setRandomConnectivity() : SparseMsg
• setRandomSeed() : moose::RNG< T >
• setRate() : RandSpike
• setRates() : BidirectionalReaction , ExternReac , MMEnzymeBase , RateTerm , ZeroOrder
• setRatio() : CplxEnzBase
• setReacKb() : Stoich
• setReacKf() : Stoich
• setReactantIndex() : FuncTerm
• setReactants() : FuncRate , FuncReac
• setRecvBuf_ : PostMaster
• setRecvBufSize : PostMaster
• setReflectivity() : Boundary
• setRefractoryPeriod() : IntFire , moose::IntFireBase
• setRefractT() : RandSpike , SpikeGen
• setRelativeAccuracy() : MarkovGslSolver
• setRepeat() : Field< A > , LookupField< L, A > , SetGet1< A >
• setResistance() : RC
• setRm() : HSolve , moose::CompartmentBase
• setRM() : Neuron
• setRmByTau() : IzhikevichNrn
• setRpower() : EndoMesh
• setRscale() : EndoMesh
• setRunString() : PyRun
• setRuntime() : Annotator
• setSaturation() : DiffAmp , PIDController
• setScale() : Adaptor , Nernst
• setSecondDelay() : PulseGen
• setSecondLevel() : PulseGen
• setSecondWidth() : PulseGen
• setSeed() : HSolve , moose::RNG< T > , SparseMsg
• setSendBuf_ : PostMaster
• setSendSize_ : PostMaster
• setSensed() : PIDController
• setSeparateSpines() : NeuroMesh
• setSeqDt() : SeqSynHandler
• setSequencePower() : SeqSynHandler
• setSequenceScale() : SeqSynHandler
• setShaftDiameter() : Spine
• setShaftLength() : Spine
• setShapeMode() : DifBufferBase , DifShellBase
• setShellElement() : Shell
• setSize() : SparseMatrix< T >
• setSolver() : Annotator , EnzBase , ReacBase , ZombieEnz , ZombieFunction , ZombieMMenz , ZombieReac
• setSolverClock() : Cell
• setSolverName() : Cell
• setSourceFile() : Neuron
• setSpaceToMesh() : CubeMesh
• setSpecies() : PoolBase , Stoich
• setSpineAndPsdDsolve() : Neuron
• setSpineAndPsdMesh() : Neuron
• setSpineDistribution() : Neuron
• setStartFid() : NeuroNode
• setStartTime() : StimulusTable
• setState() : MarkovChannel
• setStateLabels() : MarkovChannel
• setStencilSize() : MeshCompt
• setStepPosition() : StimulusTable
• setStepSize() : StimulusTable
• setStoich() : Dsolve , Gsolve , GssaVoxelPools , Ksolve , SteadyState , VoxelPools , ZombiePoolInterface
• setStopTime() : StimulusTable
• setStride() : DiagonalMsg
• setSubTree() : NeuroMesh
• setSubTreePath() : NeuroMesh
• setSurface() : CubeMesh
• setSurround() : EndoMesh
• setSy() : Interpol2D
• setSynapseOrder() : SeqSynHandler
• setSynapseOrderOption() : SeqSynHandler
• setTable() : VectorTable
• setTableA() : HHGate2D , HHGate
• setTableB() : HHGate2D , HHGate
• setTableValue() : Interpol2D
• setTableVector() : Interpol2D
• SETTAG : PostMaster
• setTarget() : FuncTerm
• setTargetField() : SingleMsg
• setTau() : CaConcBase , HHGate , IntFire , moose::VClamp
• setTau1() : SynChan
• setTau2() : SynChan
• setTauB() : CaConcStruct , HSolve
• setTauCa() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setTauD() : PIDController
• setTauI() : PIDController
• setTauMinus() : STDPSynHandler
• setTauPlus() : STDPSynHandler
• setTauSyn() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setTauThresh() : moose::AdThreshIF
• setTauW() : moose::AdExIF
• setTd() : moose::VClamp
• setTemperature() : Nernst , NMDAChan
• setTextColor() : Annotator
• setTheta() : Neuron
• setThetaD() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setThetaP() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setThickness() : CaConcBase , DifBufferBase , DifShellBase , PsdMesh
• setThis() : Mstring , Neutral
• setThresh() : IntFire , moose::IntFireBase
• setThreshAdaptive() : moose::AdThreshIF
• setThreshJump() : moose::AdThreshIF
• setThreshold() : SpikeGen , SpikeStats , Table
• setTi() : moose::VClamp
• setTick() : Element , Neutral
• setTickDt() : Clock
• setTickStep() : Clock
• settle() : SteadyState
• settleFunc() : SteadyState
• setTotal() : SteadyState
• setTotalLength() : Spine
• setTrigMode() : PulseGen
• setU() : moose::IzhIF
• setU0() : IzhikevichNrn
• setUInit() : moose::IzhIF
• setup() : HinesMatrix , HSolve , HSolveActive , HSolvePassive
• setupAlpha() : HHGate
• setupCrossSolverReacs() : Dsolve
• setupCrossSolverReacVols() : Dsolve
• setupf() : Cell
• setupGate() : HHGate
• setupMatrix() : SteadyState
• setupSlaveMsg() : ReadKkit
• setupSolver() : Cell
• setupSSmatrix() : SteadyState
• setupTables() : HHGate
• setupTau() : HHGate
• setUseConcentration() : HHChannel2D , HHChannelBase
• setUseInterpolation() : HHGate
• setUseSpikeMode() : Table
• setUseStreamer() : Table
• setUseTrigger() : Function
• setV0() : RC
• setVal() : MMPump
• setValence() : DifShellBase , Nernst
• setValue() : Variable
• setVar() : Func , Function
• setVarValues() : Func , Function
• setVCritical() : moose::QIF
• setVDiv() : HSolve
• setVec() : Field< A > , LookupField< L, A > , SetGet1< A > , SetGet2< A1, A2 > , TableBase
• setVecSize() : TableBase
• setVin() : moose::VClamp
• setVm() : HSolve , IntFire , IzhikevichNrn , MarkovChannel , MarkovRateTable , moose::CompartmentBase
• setVm1() : GapJunction
• setVm2() : GapJunction
• setVMax() : HSolve
• setVmax() : IzhikevichNrn , MMPump
• setVMin() : HSolve
• setVolScale() : FuncTerm
• setVolume() : DifBufferBase , DifShellBase , PoolBase , SpineEntry , VoxelPoolsBase
• setVolumeAndDependencies() : GssaVoxelPools , VoxelPools , VoxelPoolsBase
• setVolumeNotRates() : ChemCompt
• setVPeak() : moose::ExIF , moose::IzhIF
• setVpower() : EndoMesh
• setVReset() : moose::IntFireBase
• setVscale() : EndoMesh
• setVtChildTable() : MarkovRateTable
• setW() : moose::AdExIF
• setWeight() : Synapse
• setWeightMax() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler , STDPSynHandler
• setWeightMin() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler , STDPSynHandler
• setWeightScale() : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler
• setWidth() : PulseGen
• setWindowLength() : Stats
• setX() : Annotator , CylBase , Func , HHChannel2D , HHChannelBase , HSolve , moose::CompartmentBase
• setX0() : CubeMesh , CylMesh , moose::CompartmentBase
• setX1() : CubeMesh , CylMesh
• setXdivs() : Interpol2D , MarkovSolverBase
• setXdivsA() : HHGate2D
• setXdivsB() : HHGate2D
• setXindex() : HHChannel2D
• setXmax() : Interpol2D , Interpol , MarkovSolverBase
• setXmaxA() : HHGate2D
• setXmaxB() : HHGate2D
• setXmin() : Interpol2D , Interpol , MarkovSolverBase
• setXminA() : HHGate2D
• setXminB() : HHGate2D
• setXpower() : HHChannel2D , HHChannelBase
• setXY() : Func
• setXYZ() : Func
• setY() : Annotator , CylBase , Func , HHChannel2D , HHChannelBase , HSolve , moose::CompartmentBase
• setY0() : CubeMesh , CylMesh , moose::CompartmentBase
• setY1() : CubeMesh , CylMesh
• setYdivs() : Interpol2D , MarkovSolverBase
• setYdivsA() : HHGate2D
• setYdivsB() : HHGate2D
• setYindex() : HHChannel2D
• setYmax() : Interpol2D , MarkovSolverBase
• setYmaxA() : HHGate2D
• setYmaxB() : HHGate2D
• setYmin() : Interpol2D , MarkovSolverBase
• setYminA() : HHGate2D
• setYminB() : HHGate2D
• setYpower() : HHChannel2D , HHChannelBase
• setZ() : Annotator , CylBase , Func , HHChannel2D , HHChannelBase , HSolve , moose::CompartmentBase
• setZ0() : CubeMesh , CylMesh , moose::CompartmentBase
• setZ1() : CubeMesh , CylMesh
• setZindex() : HHChannel2D
• setZk() : MgBlock
• setZpower() : HHChannel2D , HHChannelBase
• shaft_ : NeuroMesh , SpineEntry
• shaftId() : SpineEntry
• shaftId_ : SpineEntry
• shapeMode_ : DifBuffer , DifShell
• SharedFinfo() : SharedFinfo
• sharedFinfos_ : Cinfo
• sharedVec : Test
• Shell() : Shell
• shell_ : Cell , ReadCell , ReadKkit
• shelle_ : Shell
• showFields() : Element
• showMatrices() : SteadyState
• showMatricesFunc() : SteadyState
• showMsg() : Element
• shuffleRows() : FastElim , FastMatrixElim
• sigma_ : moose::normal_distribution< T >
• simdt_ : ReadKkit
• SimpleLogger() : SimpleLogger
• SimpleSynHandler() : SimpleSynHandler
• simulationTime : SimpleLogger
• SingleMsg() : SingleMsg
• Sinit() : VoxelPoolsBase
• Sinit_ : VoxelPoolsBase
• size() : Conv< T > , Conv< bool > , Conv< double > , Conv< float > , Conv< Id > , Conv< int > , Conv< short > , Conv< string > , Conv< unsigned int > , Conv< unsigned short > , Conv< vector< T > > , Conv< vector< vector< T > > > , Dinfo< D > , DinfoBase , HSolveUtils::Grid , PrepackedBuffer , VoxelPoolsBase , ZeroSizeDinfo< D >
• size_ : DataElement , MarkovRateTable , MarkovSolverBase , NonlinearSystem
• sizeIncrement() : Dinfo< D > , DinfoBase , ZeroSizeDinfo< D >
• sizeIncrement_ : Dinfo< D >
• slope() : NonlinearSystem
• slopes_ : NonlinearSystem
• solutionStatus_ : SteadyState
• solve() : HSolvePassive
• solver_ : Annotator
• solverClock_ : Cell
• solverName_ : Cell
• SOMA : SwcSegment
• soma_ : Neuron
• sourceFile_ : Neuron
• sources() : DiagonalMsg , Msg , OneToAllMsg , OneToOneDataIndexMsg , OneToOneMsg , SingleMsg , SparseMsg
• spaceToIndex() : CubeMesh
• SparseMatrix() : SparseMatrix< T >
• SparseMsg() : SparseMsg
• Species() : Species
• species_ : Pool , Stoich
• spike() : Table
• SpikeGen() : SpikeGen
• spikegen_ : HSolveActive
• spikegens() : HSolveUtils
• SpikeGenStruct() : SpikeGenStruct
• spikeOut() : moose::IntFireBase
• SpikeRingBuffer() : SpikeRingBuffer
• SpikeStats() : SpikeStats
• Spine() : Spine
• spineDistribution_ : Neuron
• SpineEntry() : SpineEntry
• spineEntry_ : Neuron
• spineIds() : Neuron
• SpineMesh() : SpineMesh
• spineParentSegIndex_ : Neuron
• spines() : SpineMesh
• spines_ : Neuron , SpineMesh
• spineStoich_ : Neuron
• spineToMeshOrdering_ : Neuron
• src() : FinfoWrapper , SharedFinfo
• src_ : SharedFinfo
• SrcFinfo() : SrcFinfo
• SrcFinfo0() : SrcFinfo0
• SrcFinfo1() : SrcFinfo1< T >
• SrcFinfo2() : SrcFinfo2< T1, T2 >
• SrcFinfo3() : SrcFinfo3< T1, T2, T3 >
• SrcFinfo4() : SrcFinfo4< T1, T2, T3, T4 >
• SrcFinfo5() : SrcFinfo5< T1, T2, T3, T4, T5 >
• SrcFinfo6() : SrcFinfo6< T1, T2, T3, T4, T5, T6 >
• srcFinfoName() : Cinfo
• srcFinfos_ : Cinfo
• stage_ : HinesMatrix
• start() : Shell
• start_ : StimulusTable
• startDataIndex() : Element , FieldElement , GlobalDataElement , LocalDataElement , MsgElement
• startFid() : NeuroNode
• startFid_ : NeuroNode
• startGraftCell() : ReadCell
• startTime : SimpleLogger
• startVoxel_ : Gsolve , Ksolve
• state_ : HSolveActive , MarkovChannel , MarkovGslSolver , MarkovSolverBase , RC , TimeTable
• stateGsl_ : MarkovGslSolver
• stateLabels_ : MarkovChannel
• stateType_ : SteadyState
• Stats() : Stats
• status_ : SteadyState , Stoich
• STDPSynapse() : STDPSynapse
• STDPSynHandler() : STDPSynHandler
• SteadyState() : SteadyState
• Stencil() : Stencil
• step() : HSolveActive
• stepPosition_ : StimulusTable
• stepSize_ : StimulusTable
• stimIds_ : ReadKkit
• stimMap_ : ReadKkit
• StimulusTable() : StimulusTable
• StochNOrder() : StochNOrder
• StochSecondOrderSingleSubstrate() : StochSecondOrderSingleSubstrate
• stoich : GssaSystem
• Stoich() : Stoich
• stoich_ : SteadyState , ZombieEnz , ZombieMMenz , ZombiePoolInterface , ZombieReac
• stoichPtr_ : Gsolve , Ksolve , VoxelPoolsBase
• stop() : Clock
• stop_ : StimulusTable
• storeInflux() : DifShellBase
• storeOutflux() : DifShellBase
• storeTree() : HSolvePassive
• str2Id() : Id
• str2val() : Conv< T > , Conv< bool > , Conv< double > , Conv< float > , Conv< Id > , Conv< int > , Conv< short > , Conv< string > , Conv< unsigned int > , Conv< unsigned short > , Conv< vector< T > > , Conv< vector< vector< T > > >
• Streamer() : Streamer
• StreamerBase() : StreamerBase
• strGet() : DestFinfo , ElementValueFinfo< T, F > , FieldElementFinfoBase , Finfo , LookupElementValueFinfo< T, L, F > , LookupValueFinfo< T, L, F > , ReadOnlyElementValueFinfo< T, F > , ReadOnlyLookupElementValueFinfo< T, L, F > , ReadOnlyLookupValueFinfo< T, L, F > , ReadOnlyValueFinfo< T, F > , SetGet , SharedFinfo , SrcFinfo , ValueFinfo< T, F >
• stride_ : Clock , DiagonalMsg
• strSet() : DestFinfo , ElementValueFinfo< T, F > , FieldElementFinfoBase , Finfo , LookupElementValueFinfo< T, L, F > , LookupValueFinfo< T, L, F > , ReadOnlyElementValueFinfo< T, F > , ReadOnlyLookupElementValueFinfo< T, L, F > , ReadOnlyLookupValueFinfo< T, L, F > , ReadOnlyValueFinfo< T, F > , SetGet , SharedFinfo , SrcFinfo , ValueFinfo< T, F >
• sub() : EnzBase , ReacBase
• sub_ : MMenz , MMEnzyme1 , Reac
• subComptVec_ : Stoich
• substrates_ : MMEnzyme
• subTreePath_ : NeuroMesh
• subzero : XferInfo
• sum_ : Adaptor , Stats
• sum_inject_ : IzhikevichNrn
• sumInject_ : moose::Compartment
• sumIntoEntry() : RollingMatrix
• sumIntoRow() : RollingMatrix
• sumRaxial() : SymCompartment
• sumsq_ : Stats
• SURFACE : CubeMesh
• surface() : CubeMesh
• surface_ : CubeMesh
• surfaceGranularity_ : CylMesh , NeuroMesh , PsdMesh , SpineMesh
• surround_ : EndoMesh
• Svec() : VoxelPoolsBase
• swapped : ConcChanInfo
• SwcBranch() : SwcBranch
• SwcSegment() : SwcSegment
• sy_ : Interpol2D
• SymCompartment() : SymCompartment
• symmetricFlag_ : ReadCell
• Synapse() : Synapse
• synapseOrder_ : SeqSynHandler
• synapseOrderOption_ : SeqSynHandler
• synapses_ : GraupnerBrunel2012CaPlasticitySynHandler , SeqSynHandler , SimpleSynHandler , STDPSynHandler
• SynChan() : SynChan
• synchan_ : HSolveActive
• synchans() : HSolveUtils
• SynEvent() : SynEvent
• SynHandlerBase() : SynHandlerBase
• synIndex : PreSynEvent
• sys_ : Gsolve
• system() : NonlinearSystem